Kishuku Gakkou no Juliet revisite librement l’histoire de Roméo et Juliette dans un cadre scolaire. À l’académie Grigio, les élèves sont divisés en deux dortoirs représentant des nations rivales. Romeo Inudzuka et Juliet Percia, leaders respectifs de chaque camp, vivent une histoire d’amour secrète, risquant gros si leur relation venait à être découverte.