C’est le début des vacances d’été, mais Ruka s’ennuie déjà après avoir été exclue de son club de handball. Alors qu’elle erre près du port de Tokyo, elle croise Umi, un garçon mystérieux lié à la mer. Plus tard, elle le retrouve à l’aquarium où travaille son père, accompagné de Sora, un autre garçon étrange. Tous deux possèdent des dons surnaturels liés à l’océan… un monde fascinant et inquiétant s’ouvre alors à Ruka.