Yaiba, un jeune samouraï élevé dans la jungle par son père Kenjûrô, a rapidement développé un talent exceptionnel pour le combat au sabre. Sa vie bascule lorsqu’ils quittent la forêt pour Tokyo, où Kenjûrô retrouve un vieil ami, Raizô. Sans hésiter, ils s’installent chez lui.
C’est ainsi que Yaiba découvre la vie citadine aux côtés de Sayaka, la fille de Raizô. Mais il ne tarde pas à attirer l’attention grâce à ses talents de bretteur, ce qui pousse le maître du dojo local à le confronter à son meilleur élève : Takeshi Onimaru.
Entre rivalité et provocations, Yaiba pousse Onimaru à bout, donnant naissance à un affrontement explosif. Décidé à prendre sa revanche, Onimaru met la main sur un sabre légendaire enfermant l’esprit du dieu du vent... Un nouveau combat s’annonce, bien plus dangereux que le précédent.